江海軍區(qū)批準(zhǔn)了鳳凰山基地的聯(lián)合作戰(zhàn)訓(xùn)練模型“越過海洋”，并要求鳳凰山基地盡快完成對(duì)這一模型的測試和調(diào)試，完善有關(guān)軟件，準(zhǔn)備容納部隊(duì)訓(xùn)練。在調(diào)試過程中，使用先進(jìn)武器裝備和先進(jìn)訓(xùn)練手段之后的訓(xùn)練管理問題日漸突出，郭長慶(楊樹泉 飾)等人在現(xiàn)代軍事素養(yǎng)方面的差距日益明顯，他試圖通過一些捷徑來彌補(bǔ)差距，結(jié)果只能是走上弄虛作假的道路。江永良(王強(qiáng) 飾)好心給他補(bǔ)課，反被看作是有意拆臺(tái)、居心叵測、搶班奪權(quán)，兩人間暴發(fā)了激烈的沖突。郭長慶進(jìn)行權(quán)力操作，企圖逐走江永良，受到了軍區(qū)領(lǐng)導(dǎo)的嚴(yán)厲批評(píng)。

孔令光回國后，鼓起勇氣，向田夢虹(張雅欣 飾)(張雅欣 飾)表達(dá)愛意，被田夢虹婉言拒絕。不久，孔令光調(diào)至某部空中特勤大隊(duì)任大隊(duì)長，在執(zhí)行驅(qū)逐侵入我國領(lǐng)空的外國戰(zhàn)機(jī)的任務(wù)時(shí)發(fā)生意外，飛機(jī)墜入大海。江永良帶領(lǐng)基地船隊(duì)配合海軍全力搜索，也沒有發(fā)現(xiàn)孔令光的蹤影。田夢虹深感內(nèi)疚，她不顧江永良的勸解，遠(yuǎn)走它鄉(xiāng)。

江海軍區(qū)領(lǐng)導(dǎo)忽然來到鳳凰山基地，考核基地領(lǐng)導(dǎo)班子，郭長慶等一批軍官因多項(xiàng)考核分?jǐn)?shù)不及格而被免去了職務(wù)，江永良被任命為基地司令。江永良修改聯(lián)合作戰(zhàn)訓(xùn)練模型，刪除了團(tuán)和排兩個(gè)節(jié)點(diǎn)，以提高指揮效率和反應(yīng)速度。此舉引來了很大的爭議。許多人向羅懷中(翟萬臣 飾)告狀，各方面領(lǐng)導(dǎo)也十分關(guān)注這一信息，羅懷中表示既然已經(jīng)把鳳凰山基地定性為“特區(qū)”，就應(yīng)該允許進(jìn)行各種實(shí)驗(yàn)。

黃鐵桂被開釋后，認(rèn)識(shí)到了自己的錯(cuò)誤，主動(dòng)來基地道歉。江永良通過田夢虹，設(shè)法替他找回了老婆。黃鐵桂感激萬分。鳳凰山基地以此為契機(jī)，恢復(fù)了同云西村的良好關(guān)系。