九年后成為審判官的孟書娟(張歆怡 飾)回到南京，此次要在南京進(jìn)行對日軍二級戰(zhàn)犯審判。

日本百姓認(rèn)為大和民族是貴胄，他們在亞洲的戰(zhàn)爭實(shí)際是在解放亞洲，南京大屠殺時(shí)廣島居民反而在連夜狂歡慶祝。

朱光煜(郭廣平 飾)在審戰(zhàn)犯田中秀樹(平田康之 飾)時(shí)，田中秀樹不僅不知悔改，還自視甚高，他認(rèn)為朱光煜的官銜比他小，要態(tài)度恭敬地與他講話。朱光煜斥責(zé)他不知好歹，死到臨頭還不肯認(rèn)罪。

田中秀樹認(rèn)為廣島長崎人民無緣無故被投了兩顆原子彈也是受害者，中國現(xiàn)在不過是與蘇美等國勾結(jié)。朱光煜反駁道廣島長崎的人民實(shí)際上是日本軍國主義的受害者，如果真為日本百姓著想，這些戰(zhàn)犯就該盡快伏法，還有日軍主戰(zhàn)的將軍才不是什么拯救者，而是社會(huì)的人渣、垃圾、敗類。

在圣馬德倫教堂的從葬坑里發(fā)現(xiàn)兩千多具尸體，白骨上有明顯的刀傷，衣服也已經(jīng)腐爛，孟書娟想起了當(dāng)時(shí)她在教堂里經(jīng)歷的一切。法庭在南京市搜集人證物證，由于要出席的證人太多，他們只能選擇一些有代表性的證人出庭。

南京大屠殺二級戰(zhàn)犯審判開庭，大家紛紛佩戴上翻譯的耳機(jī)，田中秀樹在法庭上辯解自己無罪，他所做的一切是為了大和民族而戰(zhàn)，他的辯護(hù)律師甚至開解道南京大屠殺根本不存在。

朱光煜反駁道他們的辯解就是無稽之談，辯護(hù)律師當(dāng)時(shí)還在日本上學(xué)，根本沒能來南京，辯護(hù)律師表示自己跟很多日本軍官(文章 飾)都證實(shí)了日軍占領(lǐng)南京時(shí)，南京已經(jīng)沒有人，被燒的房屋里也無人居祝百姓們聽到日方辯護(hù)律師的話大聲地斥責(zé)他信口開河，胡編亂造。

玉墨(小宋佳 飾)頭戴黑色的頭紗來到了庭審現(xiàn)場，紅十字會(huì)的副會(huì)長帶著一具具白骨出庭作證，即使只剩白骨大家依舊能感受到當(dāng)時(shí)日軍的殘暴，國民黨軍官們聽到他的陳述紛紛流下眼淚。