民國(guó)初年，燕子門(mén)第十二代掌門(mén)人李耀被叛徒出賣(mài)，落入宛城巡防長(zhǎng)官虞大壽之手，虞大壽為防李耀逃跑遂將其大筋挑斷。

街頭鬧市，說(shuō)書(shū)藝人"鐵嘴霸王"正慷慨激昂地講述大名鼎鼎的江湖好漢燕子李三的傳奇故事，聽(tīng)眾中，一個(gè)衣衫襤褸的小男孩聽(tīng)得格外出神。不料，書(shū)場(chǎng)被虞大壽帶兵查封，小男孩奮起反抗卻被虞大壽打翻在地。

燕子李三行刑這一天，沿途擠滿(mǎn)了送行群眾。李耀師弟 李顯(六小齡童 飾)帶著眾徒弟混雜在群眾中伺機(jī)而動(dòng)。這時(shí)，小男孩捧著饅頭沖到囚車(chē)旁給老燕子李三送行。虞 大壽見(jiàn)又是小男孩來(lái)?yè)v亂不由大怒，鞭打小男孩，現(xiàn)場(chǎng)陷入混亂之中。李顯見(jiàn)狀趁機(jī)動(dòng)手，將囚車(chē)劫走。逃亡中李耀不幸中槍?zhuān)烙诜敲?/p>

李顯徒弟 李云飛(陳龍 飾)和 李云馨(李彩樺 飾)撤退時(shí)，被小男孩緊隨至客棧，小男孩兒自述對(duì)燕子李三的崇敬，向李顯磕頭拜師。李顯因無(wú)法考察其來(lái)歷，在小男孩磕頭之際帶著云飛云馨悄然離去。

李顯得知李耀所攜掌門(mén)信物"燕子金鏢"被虞大壽高懸于城門(mén)之上，以誘捕燕子門(mén)師徒。明知是圈套，李顯卻仍要將掌門(mén)信物奪回。他自己引開(kāi)埋伏的部 隊(duì)，派云飛和云馨去拿"燕子金鏢"，不料虞大壽早有準(zhǔn)備，云飛和云馨陷入困境。關(guān)鍵時(shí)刻，小男孩挺身而出，協(xié)助云飛拿到了"燕子金鏢"。

小男孩再次拜師，向李顯講述了他的凄苦身世，原來(lái)虞大壽與他有殺親之仇，他為報(bào)仇一心想拜在燕子門(mén)下。李顯感嘆小男孩的膽識(shí)，一摸骨相，發(fā)現(xiàn)是塊練輕功的好材料，遂在客棧將其收入門(mén)下，為他取名" 李云龍(劉峰超 飾)"。

為了引開(kāi)虞大壽派來(lái)的追兵，李顯與眾江湖人士進(jìn)行了一場(chǎng)殊死搏斗，不幸在打斗中身負(fù)重傷，危難中被日本醫(yī)生五咸長(zhǎng)滿(mǎn)所救。李顯傷愈后應(yīng)允為五咸辦三件事以報(bào)答其救命之恩，并留下三枚黑色燕子標(biāo)志作為憑證。

一晃數(shù)年，燕子門(mén)第十三代弟子李云飛、李云馨、李云龍都已長(zhǎng)大成人，新一代燕子三杰重出江湖。